Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed5Q9CXE7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms