Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms