Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms