Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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MINDY3Q9CV28 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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MINDY3Q9CV28 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MINDY3Q9CV28 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MINDY3Q9CV28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MINDY3Q9CV28 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MINDY3Q9CV28 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MINDY3Q9CV28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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