Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sycp2Q9CUU3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms