Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud1Q9CUB6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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