Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CR55 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CR55 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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