Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms