Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms