Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQM1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQM1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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