Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms