Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms