Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms