Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms