Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms