Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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