Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CQC3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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