Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms