Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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