Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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