Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms