Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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