Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms