Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms