Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms