Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms