Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms