Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms