Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf17Q99MV7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms