Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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