Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms