Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms