Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms