Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcc1Q99LI2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms