Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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