Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms