Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99KU6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99KU6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms