Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms