Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms