Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdcbp2Q99JZ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdcbp2Q99JZ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms