Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Krcc1Q99JT5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms