Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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