Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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