Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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