Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms