Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms