Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms