Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1bQ91YK2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms