Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms