Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec16bQ91XT4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec16bQ91XT4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms